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簡要描述:甲基化檢測:生物的遺傳信息主要貯存在 DNA 中,而 DNA 由 AGCT 四種堿基、核糖、磷酸基團等組成。堿基上可以發(fā)生化學修飾,最常見的形式是胞嘧啶C的第5位碳原子的甲基化,形成 5-甲基胞嘧啶(5mC)。
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DNA甲基化檢測是一種用于測定DNA序列中特定位置上的胞嘧啶是否被添加甲基基團的實驗方法。這一過程在生物學研究中尤為重要,因為DNA甲基化與基
因表達調(diào)控、早期胚胎發(fā)育、基因組印記、X染色體失活等重要生物學過程密切相關,并且可以作為腫瘤生物標志物。以下是幾個主要方面:
1. 檢測目的:DNA甲基化可以調(diào)控基因表達,因此通過檢測DNA甲基化可以為解釋基因表達的調(diào)控提供線索。由于DNA甲基化參與一系列重要的生物學過程,
如早期胚胎發(fā)育、基因組印記、X染色體失活等,因此檢測DNA甲基化有助于闡明這些生命過程背后的秘密。研究還表明,DNA甲基化可以作為
腫瘤的生物標志物,對腫瘤的發(fā)生、發(fā)展及預后具有預測意義。
2. 檢測方法:根據(jù)檢測目標的不同,檢測方法可以分為特異位點的甲基化的檢測和全基因組的甲基化分析。
特異位點的甲基化的檢測
MS-PCR:這種方法經(jīng)濟實用,無需特殊儀器,應用廣泛。它通過設計兩對引物來檢測特定CpG位點是否存在甲基化。
亞硫酸氫鹽處理+測序:被認為是DNA甲基化分析的金標準,可靠性高,但過程繁瑣、昂貴。
COBRA:相對簡單,可快速定量幾個已知CpG位點的甲基化,但只能獲得特殊酶切位點的甲基化情況。
MethyLight:利用TaqMan探針和PCR引物區(qū)分甲基化和未甲基化的DNA,高通量且高敏感性。
HRM:通過熔解曲線分析發(fā)現(xiàn)甲基化與未甲基化DNA的序列差異,簡便、快捷、精確。
焦磷酸測序:能夠快速檢測甲基化的頻率,進行定性及定量檢測,適合不同通量需求的儀器選擇。
全基因組的甲基化分析
芯片技術:如Illumina的Infinium HumanMethylation450 BeadChip芯片,以單堿基分辨率覆蓋超過45萬個甲基化位點,適用于大規(guī)模平行分析。
3. 應用場景:廣泛應用于科學研究和臨床診斷。例如,腫瘤細胞內(nèi)全基因組的低甲基化程度與疾病進展、腫瘤大小和惡性程度有密切關系,因此可
用于腫瘤的預測和診斷。此外,通過對血清及其他體液中的腫瘤細胞DNA甲基化進行檢測,輔助診斷腫瘤及判斷預后,如肺癌患者痰及乳腺癌患者的
乳頭抽吸物。
綜上所述,DNA甲基化檢測不僅在基礎生物學研究中扮演著重要角色,同時也為臨床診斷提供了有價值的生物標志物。選擇合適的檢測方法需要根據(jù)研究目標
和經(jīng)濟條件綜合考慮,從而盡可能地發(fā)揮其價值。
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