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簡要描述:全外捕獲測序?qū)嶒灧?wù)全外捕獲測序?qū)嶒灒╓hole Exome Capture Sequencing, WES)是一種高通量測序技術(shù),專注于人類基因組中編碼蛋白質(zhì)的外顯子區(qū)域。這些區(qū)域雖然只占基因組的1-2%,但包含了與個體表型相關(guān)的大部分功能性變異,以及約85%的人類致病基因突變。WES通過使用特異性的探針富集外顯子區(qū)域,然后進行高通量測序,以發(fā)現(xiàn)與疾病相關(guān)的候選基因和突變。
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全外捕獲測序?qū)嶒灧?wù)
全外捕獲測序?qū)嶒?/strong>(Whole Exome Capture Sequencing, WES)是一種高通量測序技術(shù),專注于人類基因組中編碼蛋白質(zhì)的外顯子區(qū)域。這些區(qū)域雖然只占基因組的1-2%,但包含了與個體表型相關(guān)的大部分功能性變異,以及約85%的人類致病基因突變。WES通過使用特異性的探針富集外顯子區(qū)域,然后進行高通量測序,以發(fā)現(xiàn)與疾病相關(guān)的候選基因和突變。
WES的技術(shù)流程包括樣本處理、DNA提取、文庫構(gòu)建、雜交捕獲、擴增和高通量測序。文庫構(gòu)建通常采用液相雜交技術(shù),通過與外顯子區(qū)域特異性結(jié)合的探針富集目標DNA片段。測序后,通過生物信息學(xué)分析,研究者可以獲得關(guān)于不同基因變異的詳細信息,包括單核苷酸多態(tài)性(SNPs)、插入/刪除(indels)以及可能的結(jié)構(gòu)變異。
WES在臨床研究和診斷中的應(yīng)用日益廣泛,尤其是在腫瘤學(xué)、遺傳性疾病、復(fù)雜疾病研究以及藥物治療個體化中發(fā)揮著重要作用。通過WES,醫(yī)生可以幫助診斷遺傳性疾病,發(fā)現(xiàn)腫瘤的驅(qū)動基因,以及為患者提供更為精準的治療方案。
最新的研究進展表明,全外捕獲測序?qū)嶒灧?wù)正朝著更高的檢測靈敏度和更廣泛的臨床應(yīng)用方向發(fā)展。例如,WES在腫瘤放療敏感性研究中的應(yīng)用,可以幫助發(fā)現(xiàn)不同敏感性患者攜帶的生物標志物和靶點,為精準放療提供理論支撐。此外,WES在產(chǎn)前診斷中的應(yīng)用也在提高結(jié)構(gòu)異常胎兒的診斷率。
WES相對于全基因組測序(Whole Genome Sequencing, WGS)而言,具有成本較低、數(shù)據(jù)量適中、分析更集中于編碼區(qū)域等優(yōu)勢,因此在臨床研究和診斷中被廣泛采用。隨著測序技術(shù)的不斷進步和成本的降低,WES在未來的醫(yī)學(xué)研究和臨床實踐中將扮演更加重要的角色。
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